Su pompası (hidromasaj motoru), jakuzi suyunu emerek yüksek basınçla jetlere gönderir ve kaslara yönelik güçlü, noktasal bir masaj sağlar. Hava motoru (blower) ise dışarıdan hava çekip jakuzinin tabanındaki jetlere üfleyerek binlerce küçük kabarcık oluşturur; bu da daha yumuşak, tüm vücudu saran ve "şampanya etkisi" olarak bilinen bir rahatlama sunar. İki sistem farklı masaj deneyimleri için tasarlanmıştır.

Motor gücü, jakuzideki jetlerin performansını ve masajın şiddetini doğrudan etkiler. Yetersiz güç, jetlerden gelen suyun tazyiksiz olmasına neden olurken, doğru güç jetlerin etkili çalışmasını sağlar. Genellikle her 8-10 standart su jeti için yaklaşık 1 HP güç hesaplanabilir, ancak bu, jakuzinin hacmi ve jetlerin tipine göre değişebilir.

Motorun ömrünü uzatmak için en önemlisi, jakuziyi asla susuz çalıştırmamaktır, çünkü pompa soğumak ve yağlanmak için suya ihtiyaç duyar. Emiş süzgecini düzenli olarak temizlemek ve kireçli bölgelerde periyodik kireç çözücü kullanmak da önemlidir. Sık görülen arıza belirtileri arasında motorun çalışmaması, aşırı gürültülü çalışma, motor altından su sızıntısı ve jet basıncının düşmesi yer alır.

Motor gücünün yanı sıra, pompanın üretiminde kullanılan malzeme kalitesi ve dayanıklılığı fiyatı büyük ölçüde etkiler. Korozyona dayanıklı paslanmaz çelik veya kompozit malzemelerden yapılan pompalar daha pahalıdır. Ayrıca, pnömatik buton gibi basit kontrol sistemlerine sahip pompalar daha uygun fiyatlıyken, hız ayarlı veya dijital panelli karmaşık kontrol tipleri fiyatı artırır.